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Docker イメージの利用

公式の実行用 Docker イメージを使うと，依存ライブラリの導入を行わずに FrontISTR を実行できる．Docker 本体のインストールは各環境のマニュアルを参照されたい．

イメージの取得

docker pull registry.gitlab.com/frontistr-commons/frontistr/fistr1:latest

イメージには，実行に必要な以下のライブラリが含まれている．

  • MPI: Open MPI
  • METIS
  • MUMPS
  • Trilinos ML
  • Intel MKL（x86_64 環境）

解析の実行

ホスト側の作業ディレクトリ（入力ファイルのある場所）をコンテナ内に共有して実行する．-v でディレクトリを共有し，-w で作業ディレクトリを指定する．

docker run --rm -v $PWD:/work -w /work \
  registry.gitlab.com/frontistr-commons/frontistr/fistr1:latest fistr1

イメージの既定のコマンドは fistr1 である（出典: docker/container/Dockerfile の CMD ["fistr1"]）．バージョン確認などオプションを与える場合は，イメージ名のあとにコマンドを記述する．

docker run --rm registry.gitlab.com/frontistr-commons/frontistr/fistr1:latest fistr1 -v

入力ファイルの準備や制御ファイルの記述については 解析の流れ を参照されたい．

MPI 並列実行

MPI による並列実行は，コンテナ内で mpirun を介して行う．具体的な実行コマンドや領域分割の手順は 並列処理による解析 を参照されたい．

関連項目